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聚类分析软件

聚类分析软件  1.2 官方版

二维码
  • 软件授权: 共享软件
  • 软件大小: 3.04MB
  • 软件评分:
  • 软件类型: 国产软件
  • 更新时间: 2020-04-29
  • 应用平台: Win9x/Me/NT/2000/XP/2003
  • 软件语言: 简体中文
  • 版      本: 1.2 官方版

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基本简介
聚类分析软件段首LOGO
聚类分析软件官方版软件主要用于血型、蛋白质多态、品种聚类等方面的统计分析,可自动进行杂合度、多态信息含量、遗传距离以及聚类的计算,并可自动画出聚类图。

聚类分析软件截图

聚类分析软件软件简介

  本软件主要用于计算杂合度、多态信息含量、遗传距离以及聚类分析,适用于血型、蛋白质多态、品种聚类等方面。

  若本软件所采用的计算公式不适合您,作者可以为您修改公式(收取一定费用,视公式的复杂程度)!

聚类分析软件主要功能

  1、程序界面简洁明了,各项功能一目了然,无须学习便可直接使用!

  2、命令介绍:

  (1)数据读入及预处理命令

  定义矩阵 :定义数据矩阵的大小,用“长×宽”表示,X轴方向为品种,Y轴为数据;分类数(位点数)只在用Roger公式计算遗传距离时根据需要输入,系统默认值为“1”。如输入“5”ד4”“2”,即表示有5个品种,4行数据,2个基因位点。系统最多支持255个品种,9999条数据。

  输入数据 :按定义的矩阵创建一个空白矩阵,若没有定义矩阵大小,则按当前矩阵的大小创建空白矩阵。

  读入数据 :将通过“保存矩阵”命令保存到磁盘上的数据读入到系统,系统将自动创建一个大小与之相适应的矩阵,并将全部数据读入。

  追加数据 :在当前矩阵的尾部继续添加一个已保存的数据,主要用于计算遗传距离。

  读入遗传距离 :将保存到磁盘上的遗传距离数据读入,可直接用于聚类计算。

  数据正规化 :将当前矩阵中的数据按“标准差标准化法”进行处理。注意:点此命令后,在计算遗传距离和进行聚类计算都会使用经过处理后的数据。只有在重新读入或查看原始数据后才会恢复原始数据,再进行遗传距离和聚类计算就会按照原始数据进行计算。

  (2)计算命令

  计算杂合度 :按照Nei氏公式(1974)计算出各品种的杂合度。

  计算多态性 :按照Nei氏公式(1974)计算出各品种的多态信息含量。

  计算欧氏距离 :在将各数据读入到系统后,可用此命令按照Roger公式计算出各品种之间的遗传距离。注:如未在“定义矩阵”中定义分类数(等位基因数),则系统默认其值为1。在此情况下计算得出的遗传距离与使用Mahalanobis公式计算的遗传距离是一样的。未注册用户最后3个品种的遗传距离不显示。

  计算遗传距离 :在将各数据读入到系统后,可用此命令按照Nei氏公式(1983)计算出各品种之间的遗传距离。未注册用户最后3个品种的遗传距离不显示。

  进行聚类计算 :在已计算或读入遗传距离后,可用此命令按P.H.A.Sneath等(1973)的类平均聚类法(UPGMA法,又称非加权算术平均数成对聚类法)进行系统聚类。聚类结果说明:第1列No为序列号,代表是第几次聚类;第2列D为距离系数;第3、4列breed1、breed2为参于聚类的两个品种,第5列Cluster为聚类后的新名称,第6列Content为两品种的名称。未注册用户最后3次聚类结果不显示。

  (3)数据查看及保存命令

  查看原始数据 :将原始数据读入到当前矩阵中。并清除正规化处理过的数据。

  查看遗传距离 :将读入的遗传距离或经过计算得到的遗传距离在当前矩阵中显示。

  查看聚类图 :按照聚类后的结果自动画出聚类图。

  保存聚类图 :将显示的聚类图以图象文件保存到磁盘上。未注册用户无此功能!

  保存矩阵 :将当前矩阵保存到磁盘上。若当前矩阵为原始数据,则保存原始数据;若为经过正规化处理过的数据,则保存经过处理的数据;若为杂合度,则保存杂合度;......;若为聚类结果,则保存聚类结果。未注册用户无此功能!

  数据导出 :系统自动判断当前所有矩阵中所含的数据,并将其导出为Excel文件。未注册用户无此功能!

  (4)帮助与退出命令

  帮助 :显示本文件。

  退出 :按此命令后退出系统!

聚类分析软件截图

聚类分析软件运行环境

  1、硬件环境:

  硬件名称 最低配置 建议配置

  1).CPU中央处理器 586 奔腾PⅡ以上或兼容芯片

  2).内存   32M 64M以上

  3).硬盘自由空间 1M 10M以上

  4).显示器 VGA真彩 SUPER VGA或液晶显示

  2、软件环境:

  操作系统: Windows95/98/Me/Nt/2000/Xp

  并安装有Excel97及以上版本的办公软件,否则数据无法导出为Excel格式的文件。

  3、推荐使用:Win2000或Xp操作系统+Office2000。

聚类分析软件安装步骤

  1、在华军软件园下载聚类分析软件官方版这款软件的压缩包,解压后,双击exe,进入安装界面,点击下一步

聚类分析软件截图

  2、设置软件安装位置,点击浏览可以修改默认在C盘的安装位置,建议大家选择安装在D盘,然后点击下一步

聚类分析软件截图

  3、选择持续文件夹,默认即可,点击下一步

聚类分析软件截图

  4、选择是否创建软件快捷方式,选择是,点击下一步

聚类分析软件截图

  5、确认软件安装信息,点击下一步

聚类分析软件截图

  6、聚类分析软件官方版软件正在安装,等待完成即可

聚类分析软件截图

聚类分析软件使用方法

  如何定义矩阵?

  1、运行软件,点击“定义矩阵”

聚类分析软件截图

  2、设置矩阵大小

聚类分析软件截图

  3、点击确定即可

聚类分析软件截图

聚类分析软件常见问题

  如何查看聚类分析软件官方版的帮助文件?

  在聚类分析软件官方版软件主页点击“帮助”即可快速查看帮助文件

聚类分析软件更新日志

开发GG说这次真的没有bug了~

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